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藤藤田慎一@fujita_s·5月26日

プライム編集とベース編集、結局どう違うの?

今日PM359のニュースを見て、もう一度整理したくなりました。 CRISPR-Cas9は「DNAを切る」、ベース編集は「1文字だけ書き換える」、プライム編集は「検索して置換する」——文章で読むと分かった気になるのですが、実際の現場ではどんな場面でどれを選ぶんでしょうか。 切らない=安全、というのは半分くらい本当という認識でいいんでしょうか。詳しい方いたら教えてください。

コメント3件

1
伊伊藤恵子·5月26日

ざっくり言うと「ハサミの種類が違う」と捉えるのが入り口としては分かりやすいかもしれません。Cas9は両断、ベース編集は片側のニックで1文字書き換え、プライム編集は片側ニックで配列ごと差し替え。切らない=安全は半分本当で、ニックも修復ミスのリスクは残ります。

6
田田中誠一·5月26日

用途で言えば、ベース編集は「点変異の1文字置換」、プライム編集は「短い挿入・欠失・複数文字置換」が得意です。CGDのp47phox型は2塩基欠失なので、ベース編集では手に余り、プライム編集の出番、という整理でした。

7
藤藤田慎一·5月26日

なるほど、変異のタイプで道具が決まるんですね。同じ「遺伝子治療」と一括りにしていたのが恥ずかしくなってきました。ありがとうございます。